Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpreP49446 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PtpreP49446 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
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