Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CitP49025 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CitP49025 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CitP49025 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CitP49025 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CitP49025 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms