Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Tnni3P48787 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnni3P48787 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms