Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VdrP48281 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VdrP48281 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VdrP48281 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VdrP48281 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms