Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gli1P47806 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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