Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msh2P43247 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msh2P43247 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msh2P43247 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msh2P43247 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msh2P43247 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msh2P43247 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msh2P43247 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms