Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
PtgfrP43117 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
PtgfrP43117 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms