Protein–RNA interactions for Protein: P43021

Nodal, Nodal, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NodalP43021 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NodalP43021 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NodalP43021 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
NodalP43021 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
NodalP43021 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms