Protein–RNA interactions for Protein: P41155

Ltb, Lymphotoxin-beta, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbP41155 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LtbP41155 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LtbP41155 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LtbP41155 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
LtbP41155 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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