Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Chd1P40201 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Chd1P40201 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms