Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PtprkP35822 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms