Protein–RNA interactions for Protein: P35486

Pdha1, Pyruvate dehydrogenase E1 component subunit alpha, somatic form, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdha1P35486 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Pdha1P35486 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pdha1P35486 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms