Protein–RNA interactions for Protein: P35396

Ppard, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpardP35396 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpardP35396 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PpardP35396 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PpardP35396 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PpardP35396 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
PpardP35396 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpardP35396 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpardP35396 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpardP35396 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpardP35396 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpardP35396 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpardP35396 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpardP35396 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PpardP35396 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PpardP35396 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PpardP35396 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms