Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rab20P35295 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms