Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccnd2P30280 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms