Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
VtnP29788 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
VtnP29788 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
VtnP29788 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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