Protein–RNA interactions for Protein: P28704

Rxrb, Retinoic acid receptor RXR-beta, mousemouse

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Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrbP28704 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
RxrbP28704 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RxrbP28704 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
RxrbP28704 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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