Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gjc1P28229 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Gjc1P28229 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms