Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav1P27870 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vav1P27870 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms