Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CftrP26361 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CftrP26361 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CftrP26361 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CftrP26361 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CftrP26361 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CftrP26361 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CftrP26361 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CftrP26361 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CftrP26361 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CftrP26361 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CftrP26361 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CftrP26361 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CftrP26361 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CftrP26361 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms