Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NdnP25233 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NdnP25233 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NdnP25233 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NdnP25233 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NdnP25233 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NdnP25233 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NdnP25233 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NdnP25233 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NdnP25233 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NdnP25233 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms