Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Aldh1a1P24549 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Aldh1a1P24549 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms