Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkchP23298 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkchP23298 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms