Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
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SftpcP21841 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SftpcP21841 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SftpcP21841 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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SftpcP21841 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SftpcP21841 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SftpcP21841 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SftpcP21841 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SftpcP21841 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SftpcP21841 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SftpcP21841 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
SftpcP21841 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SftpcP21841 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
SftpcP21841 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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SftpcP21841 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
SftpcP21841 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
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