Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VimP20152 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
VimP20152 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
VimP20152 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms