Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a1P19437 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ms4a1P19437 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms