Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Csn1s1P19228 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Csn1s1P19228 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms