Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Tnnc1P19123 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms