Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
PtpraP18052 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
PtpraP18052 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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