Protein–RNA interactions for Protein: P16460

Ass1, Argininosuccinate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ass1P16460 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ass1P16460 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ass1P16460 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms