Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rag1P15919 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms