Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Trim30aP15533 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Trim30aP15533 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.3 ms