Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PrphP15331 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PrphP15331 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms