Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Vpreb2P13373 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms