Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Calb1P12658 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Calb1P12658 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms