Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP11369 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP11369 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP11369 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP11369 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP11369 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP11369 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP11369 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP11369 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PolP11369 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PolP11369 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PolP11369 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PolP11369 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms