Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Prf1P10820 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Prf1P10820 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms