Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Zeb2os-201ENSMUST00000127150 1305 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Gm44146-201ENSMUST00000203508 816 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxb4P10284 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms