Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Calm2P0DP27 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Calm2P0DP27 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms