Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hoxc8P09025 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms