Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NefmP08553 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NefmP08553 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NefmP08553 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NefmP08553 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NefmP08553 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms