Protein–RNA interactions for Protein: P07214

Sparc, SPARC, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SparcP07214 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SparcP07214 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SparcP07214 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SparcP07214 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SparcP07214 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SparcP07214 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SparcP07214 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SparcP07214 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
SparcP07214 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
SparcP07214 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SparcP07214 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SparcP07214 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
SparcP07214 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms