Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TnfP06804 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TnfP06804 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnfP06804 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnfP06804 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
TnfP06804 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnfP06804 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnfP06804 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnfP06804 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TnfP06804 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TnfP06804 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms