Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04214 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04214 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P04214 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04214 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04214 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04214 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04214 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P04214 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P04214 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04214 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P04214 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P04214 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P04214 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
P04214 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms