Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tp53P02340 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms