Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
P01823 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
P01823 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
P01823 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms