Protein–RNA interactions for Protein: P01650

Ig kappa chain V-V region UPC 61, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01650 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01650 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01650 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01650 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01650 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01650 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01650 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01650 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01650 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01650 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01650 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01650 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01650 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01650 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01650 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01650 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01650 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms