Protein–RNA interactions for Protein: P01645

Ig kappa chain V-V region HP 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01645 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01645 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01645 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01645 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01645 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms