Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Casp8O89110 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Casp8O89110 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms