Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Ccl20O89093 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccl20O89093 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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